军不能对国府的攻击作有效还击。于是，日军选择对重庆进行密集式轰炸，意图把这座山城铲平。但结果重庆仍然固若金汤，只是很多民居都被炸毁，有不少无辜市民也因走避不及而毙命。据报道，前后约三万余重庆居民死于轰炸。

1941年1月25日，侵华日军在大扫荡期间在河北丰润县潘家峪村屠杀无辜村民一千两百三十人，其中含妇女儿童六百五十八人，焚毁房舍约一千间。

1942年12月5日，侵华日军在河北滦县潘家戴庄屠杀无辜百姓一千两百八十余人。

1943年5月湖南境内，畑俊六指挥手下屠杀三万余中国人，强奸当地妇女两千多人。

1943年秋，侵华日军四万余人在河北阜平县平阳村一带进行“扫荡”的八十七天中，用刀砍、活埋等手段残杀无辜村民七百多人，甚至吃被杀者的人心、人肉。